W dniach 27-30 października odbyła się konferencja IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE) w stolicy Grecji, Atenach. Na konferencji zostały omówione tematy dotyczące bioinformatyki, bioinżynierii oraz biomedycyny. Zaprezentowane badania łączyły w sobie wymienione dyscypliny i przedstawiały ich wpływ na medycynę. Główne tematy omówione na konferencji to rozwój istniejących technik i metod do wykrywania nowotworów i innych zmian patologicznych, metody zapobiegania oraz leczenia chorób.
Nasz Zakład reprezentowany był przez mgr inż. Joannę Tobiasz oraz przez mgr. inż. Kingę Leszczorz, które wyniki swoich badań przedstawiły w formie rozdziału w monografii oraz referatu zaprezentowanego na konferencji:
· Joanna Tobiasz, Christos Hatzis, and Joanna Polanska: Breast cancer heterogeneity investigation: multiple k-means clustering approach. 2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), October 28-30, 2019, Athens, Greece. p. 410-414, doi: 10.1109/BIBE.2019.00080
· Kinga Leszczorz, Omid Azimzadeh, Soile Tapio, Michael Atkinson, Joanna Polańska: Mathematical modelling and effect size analysis in support of searching for the proteomic signature of radiotherapy toxicity, 2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), October 28-30 2019: 244 - 249, Athens, Greece, 978-1-7281-4617-1, doi: 10.1109/BIBE.2019.00051

Dodano: 2019-10-30

4th European Radiation Protection Week ERPW 2019

W dniach 14-18 października na Uniwersytecie Sztokholmskim odbyła się konferencja 4th European Radiation Protection Week ERPW 2019, której tematyka obejmowała badania związane z promieniowaniem jonizującym: jego zastosowaniem w radioterapii i diagnostyce, dozymetrią, skutkami wywoływanymi niskimi i wysokimi dawkami promieniowania w roślinach i w ciele człowieka oraz potencjalnymi zagrożeniami terrorystycznymi. Nasz Zakład reprezentowany był przez mgr inż. Joannę Tobiasz, która wyniki swoich badań przedstawiła w formie posteru:
Tobiasz J., Al-Harbi N., Bin Judia S., Majid S., Alsbeih G., Polanska J., How accurately can we predict Surviving Fraction after Irradiation based on the Copy Number State?

Dodano: 2019-10-21

Stypendia w ramach własnego funduszu stypendialnego – nabór wniosków

Szanowni Państwo,
w imieniu Pana prof. dr hab. inż. Marka Pawełczyka – Prorektora ds. Nauki i Rozwoju uprzejmie informujemy, że trwają nabory wniosków o przyznanie stypendium w ramach własnego funduszu stypendialnego.
Informacje zawierające listę programów, zasady ubiegania się o stypendium oraz miejsce składania wniosków dostępne są pod link adresem.

Dodano: 2019-10-10

Profesor Polańska Dziekanem!

Jest nam niezwykle miło poinformować, że kierownik naszego zakładu prof. dr hab. inż. Joanna Polańska została powołana na stanowisko Dziekana Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki.
Serdecznie gratulujemy wielkiego sukcesu i życzymy spokojnej kadencji!

Dodano: 2019-10-01

13th Central and Eastern European Proteomic Conference

W dniach 23-26 września odbyła się 13. konferencja proteomiczna krajów Europy środkowej i wschodniej. Przedstawiciele naszych zespołów badawczych mieli okazję wymienić się doświadczeniami oraz zapoznać z bieżacymi badaniami w dziedzinach takich jak proteomika kliniczna, metabolomika lub proto-genomika. Członkowie naszego Zakładu zaprezentowali następujące referaty:
prof. dr hab. inż. Joanna Polańska: Machine Learning in the processing of proteomics data
dr inż. Anna Papież: Proteomics validation analysis for ischemic heart disease in Mayak workers
mgr inż. Katarzyna Frątczak: Comparative classification study for pan-cancer mass spectrometry imaging data
mgr inż. Anna Glodek: Can the spatial distribution in MSI support the identification of the isotopic envelope?
oraz mgr inż. Justyna Mika prezentowała poster pt. Biological processes associated with mutations present in anaplastic and papillary thyroid cancers co-existing in the same thyroid gland.

Dodano: 2019-09-23

XII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego

W dniach 19-21 września odbyło się XII Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego. Tegoroczne spotkanie miało miejsce w Krakowie, zaś poruszane tematy dotyczyły szeroko pojętej bioinformatyki, w powiązaniu z naukami matematycznymi, przyrodniczymi oraz technicznymi. Nasz Zakład był reprezentowany przez dr. inż. Franciszka Binczyka i mgr. inż. Grzegorza Mrukwę, którzy wygłosili prezentacje, oraz przez mgr inż. Joannę Tobiasz i mgr inż. Justynę Mikę, które wyniki swych prac zaprezentowały podczas sesji plakatowej. Przedstawione prace dotyczyły odpowiednio:
Can Deep Learning be a tool for feature engineering? Yes, it can. Lung tumor CT imaging case study. (Franciszek Binczyk)
Hybrid Clustering Method for Highly Dimensional Data (Grzegorz Mrukwa)
Copy Number State differences between extremely radiosensitive and extremely radioresistant patients (Joanna Tobiasz)
Modelling of T cell receptor repertoire diversity in age, sex and functionality status of its sequences (Justyna Mika)


Co więcej, dr inż. Franciszek Binczyk został wybrany podczas walnego zgromadzenia PTBI na członka komisji rewizyjnej Towarzystwa. Z dumą serdecznie gratulujemy!

Dodano: 2019-09-23

Doktoranci ZAED już po obronach

Jest nam niezmiernie miło poinformować, że w ostatnich dniach odbyły się dwie publiczne obrony rozpraw doktorskich członków naszego zespołu. W dniu 13.09.2019 miała miejsce publiczna obrona rozprawy doktorskiej mgr inż. Anny Papież zatytułowanej "Integrative data analysis methods in multi-omics molecular biology studies for disease of affluence biomarker research". Po wysłuchaniu referatu, recenzji oraz dyskusji komisja wystosowała wniosek do Rady Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki o nadanie stopnia doktora nauk technicznych w dyscyplinie inżynieria biomedyczna specjalność bioinformatyka oraz wystosowała wniosek o wyróżnieniu pracy doktorskiej
Następnie 16.09.2019 swoją publiczną obronę rozprawy zatytułowanej "Generalized Distributed Monte Carlo Feature Selection for high dimensional problems" miał mgr inż. Łukasz Król. Podobnie jak kilka dni wcześniej obrona cechowała się wysokim poziomem, a komisja wystosowała wniosek do Rady Wydziału Automatyki, Elektroniki i Informatyki o nadanie mgr. inż. Łukaszowi Królowi stopnia doktora nauk technicznych w dyscyplinie informatyka techniczna i telekomunikacja specjalność data science.
Gratulujemy i życzymy dalszych sukcesów naukowych!

Ciekawostką historyczną tego wydarzenia jest fakt, iż uchwała w sprawie nadania tytułu doktora nauk technicznych Łukasza Króla było ostatnim przegłosowanym doktoratem w historii Rady Wydziału AEiI. Pierwszy tytuł doktora nauk technicznych z ramienia struktur tego wydziału w 1965 r. otrzymała dr inż Anna Skrzywan.

Dodano: 2019-09-17

Nanopore sequencing w PHE

W dniach 29-30 lipca w Public Health England odbyło się szkolenie dotyczące nanopore sequencing. W szkoleniu wzięła udział mgr inż. Katarzyna Sieradzka. Wydarzenie to było okazją do zapoznania się z aktualnymi technikami i badaniami prowadzonymi w PHE. Szkolenie poświęcone było zarówno technicznym aspektom generacji danych z wykorzystaniem nanopore sequencing, jak również wprowadzeniu ogólnego obrazu późniejszej analizy takich danych.

Dodano: 2019-08-01

"Introduction to Immunology" na Warwick University

W dniach 8-9 lipca na Warwick University odbył się cykl wykładów zatytułowanych "Introduction to Immunology". W wydarzeniu wzięły udział dr inż. Joanna Żyła oraz mgr inż. Justyna Mika, które rozwijają narzędzia bioinformatyczne w analizie danych badających odpowiedź immunologiczną. Warsztaty poświęcone były zarówno podstawom funkcjonowania wrodzonej i nabytej odpowiedzi immunologicznej, jak i poruszały zaawansowane tematy takie jak immunoterapia, transplantologia i odpowiedź immunologiczna w nowotworach. Mamy nadzieję, że zdobyta wiedza będzie cennym źródłem zrozumienia analizowanych problemów i przyczyni się do dalszych sukcesów naukowych.

Dodano: 2019-07-16

Wybory do Rady Dyscypliny

Szanowni Państwo, miło jest nam poinformować, że w dniu dzisiejszym odbyły się wybory do Rady Dyscypliny Informatyka Techniczna i Telekomunikacja w Politechnice Śląskiej. Dwóch pracowników naszego Zakładu: prof. Bogdan Smołka i prof. Henryk Palus uzyskali w demokratycznych wyborach mandat i będą nas reprezentować w tym szacownym gremium. Gratulujemy!

Dodano: 2019-07-10