Gorąco zapraszamy na coroczne Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego, połączone z Walnym Zebraniem PTBI, które w tym roku odbędzie się w Uniejowie, w dniach 27 - 29 września 2017. Terminy nadsyłania zgłoszeń zbliżają się nieubłaganie - zapraszamy wszystkich członków do nadsyłania propozycji wystąpień, ze szczególnie gorącym zaproszeniem dla koleżanek i kolegów na wczesnych etapach kariery. Zachęcajcie również koleżanki i kolegów, którzy jeszcze nie są naszymi członkami do wzięcia aktywnego udziału w konferencji.

Więcej informacji na stronie konferencji:

Konferencja PTBI

Dodano: 2017-05-31

Bioinformatics in Toruń 2017

Jak co roku PTBI zaprasza członków, sympatyków i niestowarzyszonych do wzięcia udziału w konferencji Bioinformatics in Toruń. Konferencja odbędzie się w dniach 22-24 czerwca 2017 na Wydziale Fizyki UMK.
Jeszcze można zgłaszać plakaty, na stronie www konferencji:
Konferencja BIT

Dodano: 2017-05-31

Oferta pracy PostDoc w zakresie: molecular tumour genetics in bone sarcomas

Gorąco zachęcamy do zapoznania się z oferta pracy na stanowisku PostDoc w zespole Profesora Michaela Nathratha z Uniwersytetu Technicznego w Monachium. Planowany okres zatrudnienia to 3 lata. Podstawowym wymogiem jest znajomość i doświadczenie w programowaniu w języku R. Dodatkowym atutem będzie znajomość innych narzędzi stosowanych w analizach bioinformatycznych. Bardziej szczegółowy opis oferowanego stanowiska oraz dane kontaktowe odnaleźć można w załączniku.
Dodatkowe informacje

Dodano: 2017-05-16

Zaproszenie na kurs w ramach Akademii Geconii: Course in Medical Image Analysis

Zapraszamy do uczestnictwa w cyklu wykładów Profesora Hansa-Petera Meinzera z DKFZ Heidelberg zatytułowanych: „ Course in Medical Image Analysis”. Zajęcia odbędą się 29,30 i 31 maja 2017 roku, w godzinach od 16-18 w budynku wydziału AEiI przy ul. Akademickiej 16 w Gliwicach. Numer sali zostanie przesłany zapisanym uczestnikom w późniejszym terminie.
Zajęcia będą miały formę 1,5 godzinnego wykładu po którym Profesor przewidział minimum 30 minut na pytania i dyskusję. W czwartek 1 czerwca oraz piątek 2 czerwca prowadzenie kursu przejmie dr Christian Weber (DKFZ). Zajęcia z panem doktorem będą miały formę laboratorium podczas którego uczestnicy będą mogli wykorzystać wiedzę teoretyczną przekazaną przez pana profesora Meinzera w praktycznych zastosowaniach. Zajęcia te odbędą się podobnie jak wykłady w godzinach 16-18.
Kurs ten kierowany jest głównie do doktorantów lecz zapraszamy wszystkich zainteresowanych. Proszę mieć na uwadze fakt iż dla niektórych roczników studiów doktoranckich jest to kurs obowiązkowy. W załączniku mogą państwo odnaleźć krótkie streszczenia obydwu części kursu.

Osoby zainteresowane uczestnictwem w kursie proszone są o kontakt drogą mailową z:
Profesor Joanną Polańską : Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. lub doktorem Franciszkiem Binczykiem: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.

Serdecznie zapraszamy
Dodatkowe informacje

Dodano: 2017-05-15

Warsztaty - Bioinformatyczne Studenckie Koło Naukowe

W miniony weekend w Milówce odbyły się wspólne warsztaty naukowe gliwickiego Bioinformatycznego Studenckiego Koła Naukowego Politechniki Śląskiej BioSKN oraz wrocławskiego koła AKN BioNanopor.
W sobotnie przedpołudnie dr Aleksandra Gruca, mgr Anna Papież i mgr Joanna Żyła poprowadziły warsztaty pt. "Metody analizy szlaków sygnałowych i ontologii genowych". Po intensywnych zajęciach nie zabrakło również czasu na integrację w mniej formalnych okolicznościach i popołudniem uczestnicy wybrali się na wycieczkę do schroniska na Hali Boraczej. Wieczorem organizowana była studencka sesja plakatowa, w trakcie której studenci wykazali się ogromną aktywnością prezentując wyniki swoich badań i zadając pytania kolegom.
W niedzielny poranek prof. Małgorzata Kotulska opowiedziała o badaniach swojej grupy nad białkami amyloidowymi oraz o pułapkach jakie czekają na bioinformatyków, którzy nie potrafią właściwie przygotować danych dla swoich metod. Następnie dr Franciszek Binczyk wprowadził słuchaczy w tematykę obrazowania NMR oraz algorytmów segmentacji obrazów. Na zakończenie kilku studentów zaprezentowało wyniki badań uzyskanych w ramach swoich prac inżynierskich lub magisterskich.
Dziękujemy opiekunom, za czas poświęcony na przygotowanie warsztatów i prezentacji oraz obecność, studentom za zaangażowanie i wspólną pracę, zwłaszcza zarządowi koła BioSKN, za organizację oraz prof. Andrzejowi Świerniakowi, za finansowe wsparcie warsztatów.
Zapraszamy do galerii na fotorelację z wydarzenia.

Dodano: 2017-05-07

Oferta pracy: bioinformatyk w IGCZ PAN

Instytut Genetyki Człowieka Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu poszukuje utalentowanego i dynamicznego naukowca specjalizującego się w bioinformatyce / biologii obliczeniowej. Oferta dotyczy pracy w grupie badawczej zajmującej się molekularnymi aspektami hematoonkologii. Więcej szczegółów mogą państwo odnaleźć w załączniku.
Dodatkowe informacje

Dodano: 2017-04-27

Computational Approaches in Precision Medicine

Zapraszamy do udziału w konferencji Computational Approaches in Precision Medicine w Wiedniu, 27-28 lipca 2017. W sesjach będą uczestniczyć naukowcy ze światowych renomowanych ośrodków takich jak US FDA, Yale czy Harvard. Wśród prelegentów będzie można posłuchać m.in. Christopha Bocka z CEMM Vienna, tegorocznego laureata ISCB Overton Prize za pracę nad epigenomiką oraz Seppa Hochreitera z JKU Linz - pioniera dziedziny Deep Learning. Ze wstępnym programem warsztatów można zapoznać się pod linkiem: http://goo.gl/fxBdGS.

Dodano: 2017-04-27

12th European Molecular Imaging Meeting

W dniach 5-7 kwietnia w Kolonii, w Niemczech odbyła się dwunasta międzynarodowa konferencja European Molecular Imaging Meeting – EMIM 2017, zorganizowana przez European Society for Molecular Imaging (ESMI). Tematem przewodnim konferencji było szeroko pojęte obrazowanie molekularne, poczynając od rezonansu magnetycznego, a na spektrometrii mas kończąc.
Inż. Grzegorz Mrukwa zaprezentował tam plakat „Investigation of molecular heterogeneity of head and neck cancer in MALDI-MSI preparations”, podsumowujący wyniki prac przeprowadzonych wspólnie z prof. Moniką Pietrowską i prof. Piotrem Widłakiem z Instytutu Onkologii w Gliwicach, pod kierownictwem prof. Joanny Polańskiej.
Po raz pierwszy zostało też zaprezentowane przygotowywane przez grupę Spectre (Michał Gallus, Dariusz Kuchta, Sebastian Pustelnik, Wojciech Wilgierz, Michał Wolny) oprogramowanie do analizy danych pochodzących z eksperymentów spektrometrii mas.

Dodano: 2017-04-10

Dziewczyny na Politechniki

W dniu 30 marca 2017 roku zorganizowano Dzień Otwarty Politechniki Śląskiej pod hasłem „Dziewczyny na Politechniki”. Miło nam poinformować, że w promocji Wydziału AEiI uczestniczyły doktorantki naszego zakładu: Agnieszka Cecotka, Bożena Rolnik i Joanna Żyła. W trakcie rozmów z potencjalnymi kandydatkami na studia, Panie przedstawiały spektrum zagadnień z jakimi studenci stykają się w trakcie studiów na naszym Wydziale i omawiały szczegółowo ofertę edukacyjną WAEI. Sporo czasu w trakcie dyskusji z odwiedzającymi nasze stanowisko poświęcano również problemom rynku pracy i perspektywie zatrudnienia po ukończeniu studiów.
Dzień zakończył się "Biegiem w kasku", w którym uczestniczyły zarówno kandydatki na studia jak i studentki i doktorantki Politechniki. Nasz wydział i zakład reprezentowała Pani Joanna Żyła.

Relacja z wydarzenia znajduje się na facebooku wydziału: https://www.facebook.com/aei.polsl/
Dodatkowe informacje

Dodano: 2017-03-30

Referaty na seminarium Instytutu Max-Planck

Jest nam miło poinformować, że w dniu 28.03.2017 pracownicy naszego zakładu wygłosili referaty w ramach seminarium Methods in Bioinformatics and Statistics, na zaproszenie Max-Planck Intitute for Infection Biology. W spotkaniu uczestniczyli również lekarze i bioinformatycy z Charite University Hospital. W ramach seminarium wygłoszone zostały dwa referaty:

Michał Marczyk: Methods for knowledge discovery in high dimensional biological data.
Joanna Żyła: Ranking metrics in Gene Set Enrichment Analysis.

Wyjazd ten był okazją nie tylko do prezentacji dotychczasowych prac naszego zakładu ale zacieśnienia badań nad już istniejącym projektem. Ponadto wyjazd ten zaowocował zaproszeniem do dalszej współpracy przy kolejnych projektach z zakresu analizy danych w epidemiologii malarii. Referentom gratulujemy wystąpień i życzymy dalszej owocnej współpracy z prestiżowym Instytutem Max-Planck.

Dodano: 2017-03-29