Zapraszamy wszystkich chętnych do udziału w kolejnym kursie organizowanym w ramach Akademii GeCONiI: "Wykorzystanie narzędzi bioinformatycznych do określania ekspresji genów/transkryptów przy użyciu technologii NGS" (Next Generation Sequencing – sekwencjonowanie DNA technologiami następnych generacji). Kurs poprowadzi pan dr inż. Paweł Łabaj z Wydziału Biotechnologii Uniwersytetu BOKU w Wiedniu. Kurs odbędzie się w dniach: 29 i 30 czerwca na wydziale Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej, przy ulicy Akademickiej 16 w Gliwicach.

Szczegółowe informacje o kursie znajdują się w załączniku.

Z profilem naukowym pana doktora Łabaja można zapoznać się bezpośrednio: na stronie Uniwersytetu BOKU, na platformie Researchgate, lub w bazie Google Scholar.

Zainteresowanych prosimy o mailowy kontakt Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript..

Szczegółowy harmonogram kursu zostanie przesłany zapisanym uczestnikom w późniejszym terminie.
Dodatkowe informacje

Dodano: 2015-06-10

INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTATIONAL SCIENCE

W dniach 1-3 czerwca 2015 w Reykjaviku (Islandia) odbyła się 15 edycja międzynarodowej konferencji ICCS (INTERNATIONAL CONFERENCE ON COMPUTATIONAL SCIENCE). Konferencja jest corocznym wydarzeniem łączącym naukowców z różnych dziedzin takich jak matematyka, fizyka, czy informatyka. Spośród 20 ścieżek tematycznych przykładowe to:
· Zaawansowane numeryczne algorytmy
· Obliczenia rozproszone i równoległe
· Zaawansowane architektury obliczeniowe i nowe modele programistyczne
· Bioinformatyka
· Wizualizacja i rzeczywistość wirtualna
Podczas konferencji z referatami wystąpili pracownicy naszego zakładu:
1. Bogdan Smołka, Karolina Nurzynska: Power LBP: A novel texture operator for smiling and neutral facial display classification
oraz
2. Michal Marczyk, Grzegorz Drazek, Monika Pietrowska, Piotr Widlak, Joanna Polanska, Andrzej Polanski: Modeling of Imaging Mass Spectrometry Data and Testing by Permutation for Biomarkers Discovery in Tissues
Gratulujemy!

Dodano: 2015-06-07

Śląskie Dni Biotechnologii BAKCYL

W dniach 29 - 30 maja odbyły się pierwsze Śląskie Dni Biotechnologii BAKCYL organizowane przez Studenckie Koło Naukowe Biotechnologów oraz Bioinformatyków. Inicjatywa przeznaczona była głównie dla uczniów liceów, którzy stają przed wyborem przyszłej kariery zawodowej. Spotkania były podzielone na dwa dni, gdzie pierwszego można było usłyszeć szereg ciekawych wykładów zaproszonych gości z Instytutu Onkologii, jak i pracowników Politechniki Śląskiej. Nasz zakład reprezentowała mgr inż. Anna Papież z wykładem pod tytułem " Gramatyka dla nauki - zastosowania statystyki w medycynie". W drugim dniu młodzi naukowcy mogli uczestniczyć w warsztatach praktycznych podzielonych na 3 działy: Mikrobiologia i Biologia Molekularna, Biochemia oraz Bioinformatyka, gdzie opiekunem ostatniego laboratorium była mgr inż. Joanna Żyła. Same warsztaty prowadzone były przez studentów kierunku Biotechnologia zrzeszonych w Studenckim Kole Naukowym Biotechnologów oraz Bioinformatyków. Doskonale sprawdzili się oni w roli nauczycieli i promotorów nauki wśród młodszych kolegów, czego jako zakład im gratulujemy!

Inicjatywa okazała się sukcesem i liczymy na silne zaangażowanie studentów, jak i pracowników w przyszłym roku.

Dodano: 2015-06-02

Kurs 2015 Radiation Epidemiology and Dosimetry

W dniach 18-22 maja 2015 w Rockville w Stanach Zjednoczonych odbył się kurs naukowy 2015 Radiation Epidemiology and Dosimetry Course organizowany przez National Cancer Institute (NCI). Troje pracowników zakładu mgr Franciszek Binczyk, mgr Agnieszka Błachowicz oraz mgr Justyna Kotas, miało przyjemność wysłuchać wykładów światowej sławy specjalistów z dziedziny radiologii na temat zdrowotnych efektów popromiennych. Kurs składał się z trzech bloków tematycznych, na których przedstawiono obecnie stosowane narzędzia i metody analizy danych z badań radiologicznych, zakreślono podstawy epidemiologii, dozymetrii i statystyki oraz przedstawiono dogłębne podsumowanie wieloletnich badań naukowców na temat wpływu promieniowania na zdrowie społeczeństwa, nie zapominając o najnowszych osiągnięciach i odkryciach w opisanych dziedzinach naukowych.

Dodano: 2015-05-25

Prace dyplomowe w Zakładzie Analizy Eksploracyjnej Danych

Szanowni Państwo,
wobec niestabilności pracy wydziałowego systemu rejestracji prac dyplomowych (PD.AEI.POLSL.PL) oraz krótkiego okresu czasu jaki pozostał do podjęcia decyzji w sprawie tematów prac magisterskich i inżynierskich umieściliśmy na naszej stronie internetowej, w zakładce "Strefa Studenta" wykazy proponowanych tematów prac dyplomowych na rok akademicki 2015/2016. Zainteresowanych studentów proszę o bezpośredni kontakt z prowadzącymi.

Dodano: 2015-05-19

Śląskie Spotkania Naukowe

W dniach 15-17 maja w Ustroniu miała miejsce kolejna konferencja z serii "Śląskie Spotkania Naukowe". Celem spotkania była prezentacja badań zespołów ze zróżnicowanych powiązanych z biologią dziedzin nauki, oraz odkrywanie możliwych pól do współpracy. W spotkaniu z ramienia ZAED prezentacji dokonali:

Joanna Polańska - Metody modelowania i analizy danych stosowanych w molekularnym
obrazowaniu (Mass Spectrometry Imaging)

Łukasz Król - Analiza wpływu sylwetki genetycznej chorego na przeżywalność w
niedrobnokomórkowym raku płuca.

Dodano: 2015-05-15

Profesor Bogdan Smołka

Mamy zaszczyt poinformować, że kierownik Laboratorium Niewerbalnej Komunikacji Interpersonalnej naszego zakładu, dr hab. Bogdan Smołka, decyzją Prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej otrzymał tytuł profesora nauk technicznych. Gratulujemy serdecznie i życzymy sukcesów w dalszej karierze naukowej!

Dodano: 2015-04-29

Konferencja RECOMB 2015

W dniach 12-15 kwietnia 2015 w Warszawie odbyła się 19 już edycja międzynarodowej konferencji Research in Computational Molecular Biology RECOMB 2015.

Celem konferencji jest powiązanie nauk obliczeniowych, matematycznych, statystycznych i biologicznych. Program konferencji składał się z kilku bloków tematycznych, podczas których można było wysłuchać wykładów dotyczących najnowszych osiągnięć w dziedzinach analizy sekwencji, metod dopasowania sekwencji, struktury chromatyny, regulacji genów, drzew ewolucyjnych, splicingu, analizy powiązań, sieci, czy badania populacji i nowotworów. Podczas konferencji odbyły się dwie tury sesji posterowej, na których swoje prace prezentowało aż pięciu pracowników Zakładu Analizy Eksploracyjnej Danych (Agnieszka Błachowicz, Franciszek Binczyk, Justyna Kotas, Anna Papież i Joanna Żyła):
1. Agnieszka Blachowicz, Soile Tapio, Zarko Barjaktarovic, Rafi Benotmane, Rosemary Finnon, Christophe Badie, Simon Bouffler and Joanna Polanska. Data driven estimation of cutoffs in searching for differentially expressed proteins
2. Franciszek Binczyk, Cristian Weber, Michael Götz, Bram Stjeltjes, Klaus Maier-Hein, Hans-Peter Meinzer, Rafal Tarnawski, Barbara Bobek-Billewicz and Joanna Polanska. Determination of high-grade brain tumours internal structure based on magnetic resonance diffusion imaging and signal decomposition to Gaussian mixture model.
3. Justyna Kotas, Christophe Badie, Serge Candéias and Joanna Polańska. Usage of bootstrap sampling in comparing biological diversity of differently sized data samples
4. Anna Papiez, Michal Marczyk, Andrzej Polanski and Joanna Polanska. Identifying batch effects in high-throughput biological data using dynamic programming based approach
5. Joanna Zyla, Marzena Dolbniak, Christophe Badie, Ghazi Alsbeih and Joanna Polanska. Trend control focused integration in modeling of genotype-phenotype interactions

Wszystkim Autorom gratulujemy wystąpień!

Dodano: 2015-04-28

Zaćmienie Słońca 2015

W piątek, 20 marca, będzięmy mogli podziwiać w Polsce częściowe zakrycie Słońca przez Księżyc. Zjawisko rozpocznie się o godzinie 9.45, maksimum zaćmienia - t.j. 60% przesłonięcia - wypada o godzinie 10.45, natomiast całe zjawisko kończy się około godziny 12. Zachęcamy do skorzystania ze sprzętu astronomicznego, który udostępni dr inż. Adam Popowicz - sekretarz Polskiego Towarzystwa Miłośników Astronomii oddz. Gliwice. Będzie go można spotkać w okolicach placu z fontannami przed budynkiem Wydziału Budownictwa. Podzieli się on również z chęcią wiedzą z zakresu technik obrazowania w astronomii. Zapraszamy, a jednocześnie liczymy na sprzyjającą pogodę !

Dodano: 2015-03-20

Szkolenie z analizy danych MSI

W dniach 3-5 marca 2015 w Centrum Onkologii w Gliwicach odbyło się szkolenie z analizy danych MSI (Mass Spectrometry Imaging) w ramach inicjatywy COST. Organizatorami szkolenia byli Centrum Onkologii oraz Zakład Analizy Eksploracyjnej Danych. Zajęcia były prowadzone przez organizatorów oraz naukowców z National Physical Laboratory (Wielka Brytania), Imabiotech Campus Cite Scientifique (Francja) i Novartis Institutes for BioMedical Research (Szwajcaria).
W pierwszym dniu uczestnicy zapoznali się z metodami pozyskiwania danych MSI i wstępnego przetwarzania sygnału. W drugim dniu przedstawiono nowatorskie podejście do ilościowej analizy danych. W ostatnim dniu zaprezentowano techniki modelowania widm masowych, detekcji pików, analizy PCA i segmentacji danych.

Dodano: 2015-03-11