W dniach 9-10 lutego 2015 na Wydziale Automatyki, Elektroniki i Informatyki odbyło się szkolenie dla członków Akademii GeCONiI, doktórej należą zarówno pracownicy, jak i studenci naszego zakładu. Kurs prowadził profesora Jan Komorowki z Uniwersytetu w Uppsali. Profesor jest specjalistą w dziedzinie klasyfikacji przy pomocy zbiorów przybliżonych i przeprowadził serię wykładów oraz ćwiczeń laboratoryjnych pod tytułem "Rough Sets in Bioinformatics".
Dziękujemy Panu Profesorowi za ciekawe zajęcia i przekazaną wiedzę, a uczestnikom za zaangażowanie i aktywny udział!

Dodano: 2015-02-10

Konferencja BIOSTEC 2015

W dniach 12-19 stycznia 2015 roku, w Lisbonie, odbyła się kolejna edycja konferencji International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies BIOSTEC 2015.

Celem BIOSTEC jest zbliżenie naukowców i praktyków, w tym inżynierów, biologów, pracowników służby zdrowia i naukowców informatyków komputerowych, zainteresowanych zarówno aspektami teoretycznymi jak i zastosowaniami systemów informatycznych, metod sztucznej inteligencji, algorytmów przetwarzania sygnałów, elektroniki i innych narzędzi inżynierskich w obszarach wiedzy związanych z biologią i medycyną. BIOSTEC składa się z pięciu kolokowanych konferencji, z których każda specjalizuje się w innej dziedzinie wiedzy: BIOINFROMATICS, BIOSIGNALS, BIOIMAGING, BIODEVICES oraz HEALTHINF.
W tegorocznej edycji konferencji uczestniczyli doktoranci naszego Wydziału (Marzena Dołbniak oraz Michał Staniszewski) prezentując wyniki analiz wykonanych przy współpracy z doktorantami i pracownikami Zakładu Analizy Eksploracyjnej Danych:
1. Dolbniak M, Zyla J, Kabacik S, Manning G, Badie C, Alsbeih G, Polanska J: Is the identification of SNP-miRNA interactions supporting the prediction of human lymphocyte transcriptional radiation responses?
2. Staniszewski M, Binczyk F, Skorupa A, Boguszewicz L, Sokol M, Polanska J, Polanski A: Comparison of black box implementations of two algorithms of processing of NMR spectra.

Wszystkim Autorom gratuluję wystąpień!

Dodano: 2015-01-21

Pracownik ZAED w zarządzie misji BRITE!!!

W dniu 8 grudnia 2014 r., w związku z aktywnym udziałem w projekcie pierwszych polskich satelitów naukowych BRITE-PL, dr Adam Popowicz został członkiem zarządu głównego projektu – Brite Executive Science Team (BEST).
Dr Popowicz od 2012 roku współpracuje z Centrum Astronomicznym Mikołaja Kopernika oraz z Centrum Badań Kosmicznych. Początkowo jego prace dotyczyły identyfikacji problemów radiacyjnych na satelicie LEM oraz opracowania osłon antyradiacyjnych dla drugiego polskiego satelity – Heweliusza. W późniejszym okresie dr Popowicz skupił się na mających na celu zwiększenie precyzji przeprowadzanych pomiarów algorytmach przetwarzania zdjęć. Zaproponowana przez niego metoda została w trakcie badań pilotażowych uznana za najbardziej precyzyjną i wybrana została podstawową techniką redukcji wymiarowości przesyłanych danych. Dr Popowicz zaproponował również nowy, wspomagany dodatkowymi ruchami satelity sposób wykonywania zdjęć, który skutecznie usuwa zakłócenia występujące w tle. Pierwsze próby nowej techniki obrazowania zostały przeprowadzone i wszystko wskazuje na to, iż tak właśnie prowadzone będą badania z użyciem konstelacji BRITE.
Gratulujemy !!!

Dodano: 2014-12-15

II Seminarium Naukowe Projektu BioRadInt

W dniach 8-10 grudnia 2014 roku gościliśmy dra Christophe Badie z Public Health England, Didcot UK oraz dra Serge Candeias z CEA Alternative Energies and Atomic Energy Commission, Grenoble, Francja - partnerów projektu badawczego BioRadInt Harmonia 4 - Integrative bioinformatics methods for high throughput molecular biology experimental data in the analysis of radiosensitivity of cells and tissues, finansowanego ze środków Narodowego Centrum Nauki. W trakcie seminarium mieliśmy możliwość wysłuchania wystąpień części z naszych pracowników:
1) Justyny Kotas - "Effects of low dose radiation exposure on the repertoire of TCR genes in the mouse"
2) Marzeny Dołbniak, Joanny Żyły - "Methods of the identification of SNP-miRNA interactions supporting the prediction of human lymphocyte transcriptional radiation responses"
3) Franciszka Binczyka - "Functionality of BIORADINT database"
4) Anny Papież - "Integrative approach to gene signature selection"
5) Agnieszki Błachowicz - "Multiomics analysis of myeloid leukaemogenesis following X-irradiation".
Spotkanie było okazją do interesującej wymiany myśli na temat wpływu promieniowania niskich i wysokich dawek na funkcjonowanie organizmów oraz przyczynkiem do wielu ciekawych dyskusji.

Dodano: 2014-12-10

Molecular biology for beginners

Serdecznie zapraszamy na serię wykładów otwartych Pani Prof. dr hab. Wiesławy Widłak, o wspólnym tytule: "Molecular biology for beginners". Wykłady organizowane są w ramach projektu "Utworzenie nowej specjalności Studiów Doktoranckich w Dyscyplinie Informatyka na wydziale AEiI Politechniki Śląskiej: Eksploracja Danych (Data Mining)".

Spotkania z Panią Profesor Widłak odbywać się będą w godzinach 16:00-17:30 w sali 546, w dniach: 10, 11, 12, 16, 17, 18, 19 oraz 23 grudnia 2014 roku.

Więcej o osobie Pani Profesor Widłak oraz o prowadzonych przez jej zespól badaniach naukowych można przeczytać na stronie internetowej www.cd.io.gliwice.pl/szlaki.html.

Dodano: 2014-12-09

Gliwickie Spotkania Naukowe GSN 2014

Gliwickie Spotkania Naukowe to międzynarodowa konferencja organizowana co roku wspólnie przez Instytut Onkologii w Gliwicach oraz Politechnikę Śląską wespół ze Stowarzyszeniem Na Rzecz Wspierania Badań nad Rakiem. Tematem osiemnastej już edycji były najnowsze osiągnięcia w dziedzinie biologii molekularnej, genetyki i bioinformatyki, począwszy od badań podstawowych aż do postępowania klinicznego w leczeniu chorób nowotworowych. Spotkania odbyły się w dniach 21-22 listopada 2014 r. w Centrum Kultury Studenckiej „Mrowisko” przy Politechnice Śląskiej, uczestniczyło w nich wiele naszych Koleżanek i Kolegów, mogąc zapoznać się z wynikami badań przedstawianych w trakcie wykładów i na ponad 120 prezentacjach plakatowych. ZAED reprezentowali tam m.in.:
1) F.Binczyk, M.Marczyk, J.Polańska: Fast and efficient techniques of magnetic resonance spectra decomposition based on mixture model.
2) A.Błachowicz, S.Tapio, Z.Barjaktarovic, R.Benotmane, C.Badie, S.Bouffler, J.Polańska: Comparison study of transcriptomic and proteomic analyses of three mouse radiation induced AMLs.
3) P.Kowalska, D.Borys, M.Frąckiewicz, Z.Ostrowski: Hair removing techniques as a initial step in dermatoscopy images analysis.
4) A.Papież, C.Badie, J.Polańska: Impact of the selection of statistical test on the quality of gene signatures in an integrative analysis approach.
5) J.Żyła, G.Alsbeih, S.Kabacik, C.Badie, J.Polańska: Heredity of the G1 and G2 cell cycle phase based on genes in p53 pathway.
6) A.Abramowicz, A.Gdowicz-Kłosok, M.Kwaśniak, P.Polanowski, R.Kawczyński, J.Wydmański, M.Plechawska-Wójcik, J.Polańska, P.Widłak, M.Pietrowska: MALDI-ToF-based analyses of the low-molecular-weight fraction of serum proteome of patients with gastric cancer.
Dwie z przygotowanych przez naszych współpracowników prezentacji uzyskały wyróżnienia w ramach Best Poster Presentation Contest - mgr inż. Agnieszki Błachowicz (1st distinction) oraz mgr inż. Joanny Żyły (Student Award, 2nd distinction).

Wszystkim uczestnikom Spotkań serdecznie dziękuję za aktywny udział w tym wydarzeniu, nagrodzonym zaś gratuluję sukcesu.

Dodano: 2014-11-24

Zaproszenie na wykład prof. Wójcika

W piątek 28. listopada o godz. 9:00 w Auli B odbędzie się wykład prof. Andrzeja Wójcika z Uniwersytetu Sztokholmskiego zatytułowany "Biologiczne działanie promieniowania jonizującego i biomarkery narażenia i wrażliwości" Zapraszamy serdecznie.
Dodatkowe informacje

Dodano: 2014-11-24

Wizyta gościa z Uniwersytetu Makarere

Od 14 października gościmy w Gliwicach uczestnika programu partnerskiego Erasmus Mundus Caribu Staff Exchange, Mark'a Kagarura. Nasz gość z Ugandy jest inżynierem telekomunikacji na Uniwersytecie Makarere i w Polsce spędzi miesiąc. Podczas swojej wizyty Mark pogłębia wiedzę na temat sztucznej inteligencji oraz zaznajamia się z wieloma badaniami różnych dziedzin, prowadzonymi przez naukowców z naszego wydziału.
Dodatkowe informacje

Dodano: 2014-11-08

Śląskie Spotkania Naukowe

W dniach 24-26 października 2014 roku odbyły się w Szczyrku pierwsze „Śląskie Spotkania Naukowe” – interdyscyplinarne warsztaty zespołów badawczych działających w szeroko pojętym obszarze bio-. Celem spotkania było poznanie się osobiste pracowników śląskiej nauki oraz zapoznanie się z bieżącą tematyką naukową, metodami i sprzętem, którym dysponujemy w śląskich laboratoriach.
Nasz Zakład reprezentowała na tym spotkaniu liczna grupa pracowników i doktorantów, referaty wygłosili m.in.:
1) mgr Franciszek Binczyk: "System wspomagania diagnostyki chorób nowotworowych z wykorzystaniem wyników badań techniką magnetycznego rezonansu jądrowego"
2) mgr Agnieszka Błachowicz: "Analiza wieloplatformowa biomarkerów białaczki indukowanej promieniotwórczością"
3) mgr Grzegorz Drążek: "Metody wstępnej analizy danych proteomicznych zarejestrowanych dla techniki molekularnego obrazowania tkanek"
4) mgr Łukasz Król: "Uzupełnianie braków danych na przykładzie mikromacierzy SNP"
5) mgr Anna Papież: "Bioinformatyka integratywna w analizie radiowrażliwości"
6) mgr Joanna Żyła: "Analiza GWAS w badaniach radiowrażliwości"
oraz
7) dr Andrzej Kordecki: "Problemy kalibracji kolorymetrycznej i radiometrycznej w procesie akwizycji obrazu".
Dr Artur Bal przedstawił natomiast uczestnikom Spotkań informacje na temat prowadzonych badań oraz wyposażenia "Laboratorium obrazowania i biometrii Śląskiej Biofarmy".

Wszystkim uczestnikom serdecznie gratuluję interesujących prezentacji i dziękuję za tak aktywne wsparcie inicjatywy "Śląskich Spotkań Naukowych".
Do zobaczenia za rok!

Dodano: 2014-10-27

Współpraca z firmą Enformatic

W dniu 2 października w Rzeszowie odbyło się kolejne spotkanie pracowników ZAED z przedstawicielami firmy Enformatic Sp. z o.o. Ze strony Zakładu w spotkaniu uczestniczyli dr inż. Artur Bal i dr inż. Andrzej Kordecki, a ze strony Enformatic w spotkaniu uczestniczył m.in. jej wiceprezes Bartosz Maślanka.

Celem spotkania była prezentacja dotychczasowych wyników badań dotyczących m.in. doboru źródeł światła na potrzeby obrazowania hiperspektralnego oraz omówienie dalszych planów wspólnych prac naukowo-badawczych i rozwojowych.

Firma Enformatic jest m.in. dostawcą oprogramowania sterującego do niektórych urządzeń firmy Surface Optics Corporation, firma ta jest również dystrybutorem na terenie Unii Europejskiej sprzętu wytwarzanego przez Surface Optics w tym m.in. kamer hiperspektralnych.

Dodano: 2014-10-02