W dniach 17-19 września 2015 w Lublinie odbyło się 8 Sympozjum Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego połączony wraz z 7 Seminarium Polskiego Towarzystwa Chemii Medycznej. Sympozjum było okazją do spotkania się oraz wymiany myśli między głównymi ośrodkami bioinformatycznymi w Polsce. Nasz zakład był również silnie reprezentowany w następujących wystąpieniach:
- Binczyk F., Weber C., Goetz M., Stjeltjes B., Meier-Hein K., Tarnawski R., Polanska J.: A filtration of cerebrospinal fluid signal based on Gaussian mixture model decomposition of magnetic resonance diffusion weighted imaging data.
- Mrukwa G, Drazek G, Pietrowska M, Widlak P, Polanska J: Iterative clustering procedure for automated identification of peptide signature of molecularly heterogeneous tissue regions in tumor samples.
- Papież A., Badie C., Polanska J.: Merging high-dimensional data at the p-value level as a superior solution to entire data set fusion.
- Żyła J., Marczyk M., Polanska J.: Searching for radiosensitivity biomarkers by Monte Carlo feature selection and rought sets approach.

Zapraszamy do fotorelacji w naszej galerii!

Dodano: 2015-09-30

Konferencja MMAR 2015

W dniach 24-27 sierpnia 2015 w Miedzyzrojach odbyła się 20 edycja konferencji International Conference on Methods and Models in Automation and Robotics.
Konferencja MMAR to spotkanie badaczy z krajowych oraz zagranicznych ośrodków naukowych zajmujących się szeroko rozumianą automatyką, robotyką i sztuczną inteligencją. MMAR jest największą cykliczną międzynarodową konferencją naukową z tej dziedziny organizowaną w Polsce.

Podczas konferencji wygłoszone został referaty: "Real-Time Detection and Filtering of Eye Movement and Blink Related Artifacts in EEG", którego autorami są mgr inż. Bartosz Binias, dr hab. inż. Henryk Palus (prof. nzw. Pol.Śl.) i dr inż. Krzysztof Jaskot, oraz "Fast Vignetting Reduction Method for Digital Still Camera" autorstwa dra inż. Andrzeja Kordeckiego, dra hab. inż. Henryk Palus (prof. nzw. Pol.Śl.) i dra inż. Artura Bala.

Dodano: 2015-09-28

konferencja BRITE

W dniach 14 - 18 września 2015 w Gdańsku odbyła się 1-sza naukowa konferencja BRITE "Science with BRITE-Constellation: initial results". Podczas konferencji wygłoszony został referat pt. "BRITE CCD data defects and reduction of observations in traditional mode", autorstwa dra inż. Adama Popowicza.

Dodano: 2015-09-28

Konferencja ICCSE 2015

W dniach 22-24 lipca 2015 w Cambridge (Wielka Brytania) odbyła się 10 edycja konferencji International Conference on Computer Science & Education, poświęconej zagadnieniom takim jak: sztuczna inteligencja, grafika komputerowa, inżynieria oprogramowania, technologie baz danych, chmura obliczeniowa, czy też inżynieria biomedyczna.
Podczas konferencji wygłoszony został referat pt. "Adaptive Trimmed Averaging Filter for Noise Removal in Color Images", którego autorami są prof. dr hab. Bogdan Smołka i mgr inż. Krystian Radlak.

Dodano: 2015-09-17

Kurs - Metody bioinformatyczne stosowane w planowaniu leków

W najbliższym czasie odbędzie się kolejny kurs w ramach Akademii GeCONiI. Dotyczył będzie zagadnień chemioinformatyki i biofizyki w zastosowaniu medycznym, a jego tytuł to: Metody bioinformatyczne stosowane w planowaniu leków.

Prowadzącym kurs jest prof. Jacek Tuszyński, specjalista w dziedzinie projektowania leków in silico. Prelegent jest członkiem zespołu Onkologii Eksperymentalnej na Wydziale Onkologii, University of Alberta.

Kurs planowany jest w godzinach popołudniowych (15:00-17:00) w dniach od 1 do 7 października. Szczegółową listę zagadnień, które zostaną poruszone w trakcie kursu znajdą Państwo tutaj.

Zgłoszenia prosimy przesyłać pod adres Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript..

Dodano: 2015-09-16

Akademia GeCONiI - zaproszenie

Wszystkich chętnych zapraszamy do udziału w kolejnym kursie szkoleniowym realizowanym w ramach akademii GeCONiI: „Modele matematyczne w ocenie ryzyka – zdrowotne efekty i ryzyko promieniowania jonizującego: od komórek do człowieka”. Szkolenie poprowadzi prof. Andrzej Wójcik z Uniwersytetu w Sztokholmie. Kurs odbędzie się w dniach 28 i 29 września 2015 na Wydziale Automatyki, Elektroniki i Informatyki Politechniki Śląskiej, przy ulicy Akademickiej 16 w Gliwicach.

Więcej informacji na temat kursu można znaleźć tutaj.

Profil naukowy prof. Wójcika jest zamieszczony w załączniku.

Zainteresowanych prosimy o wysyłanie zgłoszeń pod adres: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript..

Dodano: 2015-09-03

SSBSS 2015

W dniach 5-9 lipca 2015 w miejscowości Taormina, Włochy odbyła letnia szkoła poświęcona biologii systemów - International Synthetic and Systems Biology Summer School (SSBSS 2015). Tematyka poruszana w trakcie kursu opiewała w szereg ciekawych zagadnień takich jak: tworzenie syntetycznego genomu, analiza ścieżek sygnałowych w komórce, modelowanie biosystemów, analiza danych wysokoprzepustowych czy zastosowania biologii syntetycznej w przemyśle. W trakcie szkolenia młodzi naukowcy mieli również możliwość prezentacji swoich prac w postaci plakatów. Nasz zakład reprezentowały: mgr inż. Anna Papież oraz mgr inż. Joanna Żyła, a ponadto na kursie swoje prace przedstawili inni doktoranci naszej uczelni mgr inż. Marzenia Dołbniak i mgr inż. Wojciech Łabaj. Przedstawiamy Państwu pełną listę wystąpień wraz z autorami, a naszym młodym naukowcom życzymy wykorzystania zdobytej wiedzy w swojej codziennej pracy naukowej. Zapraszamy również do galerii, na krótką relacje zdjęciową z konferencji.

1) Marzena Dolbniak: The exploration of single-cell protein expression data
2) Anna Papiez, Christophe Badie, Joanna Polanska: P-Value Integration as a technique for validating high-throughput biomedical experiments
3) Wojciech Labaj: Improved stability of gene signature based on new heuristic GO annotation algorithm
4) Joanna Zyla, Christophe Badie, Ghazi Alsbeih, Joanna Polanska: Comprehensive multiomics analysis of radiosensitivity phenomena

Dodano: 2015-08-18

Konferencja IbPRIA 2015

W dniach 17-19 czerwca 2015 odbyła się kolejna VII edycja konferencji Iberian Conference on Pattern Recognition and Image Analysis. Konferencja jest bezpośrednio związana z tematyką przetwarzania obrazów oraz rozpoznawania wzorców.
Podczas konferencji wygłoszony został referat "Escaping Path Approach with Extended Neighborhood for Speckle Noise Reduction". Autorami doniesiania są dr inż. Marek Szczepański, mgr. inż Krystian Radlak oraz dr inż. Adam Popowicz.

Dodano: 2015-06-25

Konferencja CEEPC 2015

W dniach 15-18 czerwca w Poznaniu odbyła się 9 edycja konferencji CEEPC (Central and Eastern European Proteomic Conference). Konferencja poświęcona była różnym aspektom proteomiki. Podczas wykładów oraz sesji posterowych poruszane były takie zagadnienia, jak podstawy proteomiki, jej zastosowania oraz rozwój technik eksperymentalnych. W spotkaniu wzięli udział chemicy, biolodzy, medycy oraz bioinformatycy z wielu krajów z całego świata.

Podczas konferencji z referatami oraz posterami wystąpili pracownicy naszego zakładu, jak również współpracujący z nami studenci:
1. Andrzej Polański, Michał Marczyk, Monika Pietrowska, Piotr Widłak, Joanna Polańska – Novel algorithm for highly efficient Gaussians mixture modelling in mass spektrometry
2. Michał Marczyk, Grzegorz Drążek – Different approaches to detection and quantification of spectral peaks in mass spectrometry imaging data
3. Grzegorz Drążek, Michał Marczyk, Joanna Polańska – Biomarkers Discovery by Gaussian mixture modeling and permutation tests in Imaging Mass Spectrometry Data
4. Franciszek Binczyk, Agnieszka Polnik, Maria Sokół, Joanna Polańska – GNMR – an efficient method for metabolic profile estimation by analysis of magnetic resonance spectroscopy
5. Agnieszka Błachowicz, Soile Tapio, Zarko Barjaktarovic, Rafi Benotmane, Rosemary Finnon, Christophe Badie, Simon Bouffler, Joanna Polanska – Does the way of AML induction in mice influence protein signature of cells?
6. Grzegorz Mrukwa, Joanna Polańska – Tuning k-means algorithm for detection of heterogenous regions in MSI samples

Wszystkim Autorom gratulujemy wystąpień!

Dodano: 2015-06-18

III Seminarium Naukowe Projektu BioRadInt

W dniach 8-10 czerwca gościł na naszej uczelni dr Christophe Badie, kierownik grupy Cancer Genetics and Cytogenetics w Centre for Radiation, Chemicals and Environmental Hazards Public Health England, w ramach III seminarium naukowego projektu BioRadInt. Projekt ma na celu rozwój metod bioinformatycznych dla analizy procesów związanych z promieniowrażliwością w komórkach i tkankach. W trakcie spotkań podsumowanie prac zaprezentowały członkinie naszego zakładu:
Agnieszka Błachowicz - Similarities of gene and protein signature in radiation induced AMLs
Justyna Kotas - Comparisons of differently sized data based on Pielou's diversity
Anna Papież- Integrative approach for gene signature selection
Joanna Żyła - Gene Set Enrichment Analysis in SNP data and trend control focused integration of p-values

Dodano: 2015-06-10