Mgr inż. Justyna Mika, Doktorant, pokój: 749
telefon: -
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
Plan zajęć

         

Nota biograficzna:

marzec 2016 - obecnie: zatrudnienie w projekcie VIBRATO dotyczącego poszukiwania biomarkerów ekspozycji na promieniowanie.

listopad 2014 - grudzień 2015: zatrudnienie na stanowisku asystenta naukowego w projekcie GeCoNiI.

październik 2014: uzyskanie tytułu magistra z pracy dotyczącej badań wpływu niskich dawek promieniowania na rekombinację VDJ u myszy.

luty 2013 - wrzesień 2014: studia magisterskie na Politechnice Śląskiej, kierunek Biotechnologia, specjalność Bioinformatyka

styczeń 2013: uzyskanie tytuły inżyniera z pracy poświęconej wykorzystaniu metod bioinformatycznych w poszukiwaniu tła genetycznego raka tarczycy

październik 2009 - styczeń 2013: studia inżynierskie na Politechnice Śląskiej, kierunek Biotechnologia

Rozwiń/Zwiń

Zainteresowania naukowe:

eksploracja i analiza danych medycznych, głównie pochodzących z badań radiologicznych,

rekombinacja VDJ,

środowisko R.

Lista publikacji:

1. Glodek, A. (2022). Fuzzy-inference system for isotopic envelope identification in Mass Spectrometry Imaging data. In: Rojas, I., Valenzuela, O., Rojas, F., Herrera, L.J., Ortuño, F. (eds) Bioinformatics and Biomedical Engineering. IWBBIO 2022. Lecture Notes in Computer Science, vol 13347. Springer, Cham.

2. Glodek, A. (2022). Isotopic envelopes identification based on spatial distribution and SVM classification. European Molecular Imaging Meeting – EMIM 2022, Thessaloniki, Greece, 15-18.03.2022

3. Glodek, A., Polanska, J. (2022).SVM classifier for isotopic envelopes identification. RECOMB 2022: The 26th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology, La Jolla, USA, 26 – 30.05.2022

4. A. Cortez, A. Glodek, A. Krzywon, J. Polanska, K. M. Lisowska, Search for predictive biomarkers of sensitivity/resistance against cisplatin in high-grade serous ovarian cancer, xDigital Annual Meeting of the International Gynecologic Cancer Society (IGCS), 10-13.10.2020

5. Anna Glodek, Joanna Polańska, Zastosowanie teorii grafów do oceny interakcji microRNA-gen, Śląskie Spotkania Naukowe, 29.05.2020

6. Anna Glodek, Marta Gawin, Mykola Chekan, Monika Pietrowska, Jacek Łęski, Joanna Polańska, Can the spatial distribution in MSI support the identification of the isotopic envelope?, CEEPC 2019, 23 - 26.09.2019, Ustroń, Poland

7. Anna Glodek, Joanna Polańska: Metody identyfikacji obwiedni izotopowych w danych z obrazowania molekularnego MALDI-ToF, Śląskie Spotkania Naukowe 2019, 10-11.05.2019, Kroczyce

8. Krawczyk A, Polanska J: Comparative analysis of microRNA-target gene interaction prediction algorithms based on integrated p-value calculation. Advances in Intelligent Systems and Computing, 2018, 659:137-143, International Conference on Man-Machine Interactions, ICMMI 2017, October 3-6, 2017, Kraków

9. Gawin M, Pietrowska M, Diehl HC, Mrukwa G, Kalinowska-Herok M, Chekan M, Elm J, Drążek G, Krawczyk A, Lange D, Polańska J, Henkel C, Widłak P: Obrazowanie molekularne MALDI-MSI w klasyfikacji raków tarczycy. III Zjazd Centrum Onkologii – Instytutu im. Marii Skłodowskiej-Curie. Perspektywy w onkologii molekularnej. 5-6.04.2018 Warszawa

10. Anna Glodek, Joanna Polańska: Method for mass spectrometry spectrum deisotoping based on fuzzy inference systems. Mathematica Applicanda, 46(1):77-86, 2018 oraz XXIV Krajowa Konferencja Zastosowań Matematyki w Biologii i Medycynie, 3-7 września 2018, Zakopane-Kościelisko. doi: 10.14708/ma.v46i1.6384

11. Chekan, M; Pietrowska, M; Diehl, HC; Mrukwa, G; Kalinowska-Herok, M; Gawin, M; Elm, J; Krawczyk, A; Lange, D; Meyer, HE; Polanska, J; Henkel, C; Widlak, P: Molecular profiles of thyroid cancer: Classification based on features of tissue revealed by mas spectrometry imaging; 29th European Congress of Pathology, September 2-6, 2017, Amsterdam, NL, VIRCHOWS ARCHIV, 471: S166-S166

12. Pietrowska M, Diehl HC, Mrukwa G, Kalinowska-Herok M, Gawin M, Chekan M, Elm J, Drazek G, Krawczyk A, Lange D, Meyer H, Polanska J, Henkel C, Widlak P (2017): Molecular profiles of thyroid cancer subtypes: classification based on features of tissue revealed by mass spectrometry imaging. 9th International Conference of Contemporary Oncology: Genome based precision immuno- and targeted therapy. Poznan March 22-24, 2017, Onkologia Współczesna, 21(S1):29

13. Krawczyk A, Polanska J, Analiza porównawcza algorytmów do anotacji interakcji microRNA-gen, Śląskie Spotkania Naukowe IV SSN, 24-25.03.2017, Ustroń, Polska, p.25

14. Pietrowska Monika; Hanna Diehl; Grzegorz Mrukwa; Magdalena Kalinowska-Herok; Marta Gawin; Mykola Chekan; Julian Elm; Grzegorz Drazek; Anna Krawczyk; Dariusz Lange; Helmut E Meyer; Joanna Polanska; Corinna Henkel; Piotr Widlak: Molecular profiles of thyroid cancer subtypes: classification based on features of tissue revealed by mass spectrometry imaging. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, 2017, 1865(7):837-45, DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.10.006

15. Krawczyk A, Polanska J: Comparative analysis of microRNA-target gene interaction prediction algorithms - the attempt to compare the results of three algorithms. Bioinformatics and Biomedical Engineering, Lecture Notes in Computer Science, vol. 9656, pp. 103-112, 4th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering IWBBIO 2016, Granada,Spain, 20-22.04.2016, ISBN 978-3-319-31744-1, DOI: 10.1007/978-3-319-31744-1_10

16. Krawczyk A, Polanska J: Methods and tools used in mass spectrometry in order to perform deisotoping. OurCon IV, 4th Imaging Mass Spectrometry Conference, 17-21.10.2016, Ustroń

17. Widlak P, Pietrowska M, Diehl HC, Mrukwa G, Kalinowska-Herok M, Gawin M, Chekan M, Elm J, Drazek G, Krawczyk A, Lange D, Meyer HE, Polanska J, Henkel C: Classification of thyroid cancer subtypes based on features of tissue revealed by MALDI-MSI. OurCon IV, 4th Imaging Mass Spectrometry Conference, 17-21.10.2016, Ustroń

18. Polanska J, Mrukwa G, Drazek G, Krawczyk A, Chekan M, Pietrowska M, Widlak P: Gaussian Mixture modelling in MSI-based search for molecularly homogenous regions in cancer tissue. OurCon IV, 4th Imaging Mass Spectrometry Conference, 17-21.10.2016, Ustroń